آزمایشگاه علوم مدرسه مهر، فضایی مناسب برای کنجکاوی دانش‌آموزان است. دیوارهای آزمایشگاه با پوسترهای رنگارنگ و نمودارهای جذاب پوشیده شده‌ و هر یک برای قسمتی از بدن یا اکتشافات علمی است. گوشه و کنار میزهای کار مجهز به ابزارهای آزمایشگاهی بوده و معلمین هم به دانش‌آموزان اجازه می‌دهند که نظریات خود را عملی کنند. معمولا صداهای شاد و هیجان‌انگیز از بحث و گفتگوهای دانش‌آموزان فضای آزمایشگاه را پر کرده و انرژی مثبتی را منتقل می‌کند. آزمایشگاه مدرسه مهر نه تنها محلی برای آموزش دانش آموزان بوده، بلکه بستری برای پرورش خلاقیت و تفکری است که به دانش‌آموزان کمک می‌کند تا به آینده‌ روشن‌تری قدم بگذارند.